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基于WGCNA联合LASSO算法胃癌预后lncRNA分子标志物筛选
Identification of lncRNA molecular markers for prognosis of gastric cancer based on WGCNA Combined with LASSO
               
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作者: 刘辉;  张超;  景丽伟;  张秋萌;  常紫薇;  李兴雨;  史旋
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来源出版物:临床肿瘤学杂志卷:26期:10
关键词: 胃癌 预后 长链非编码RNA 加权基因共表达网络分析 套索算法
摘要:

目的:运用两种生物信息学方法筛选胃癌预后长链非编码RNA(lncRNA)分子标志物,为胃癌lncRNA分子机制研究提供基础。方法:下载癌症基因图谱(TCGA)胃癌和癌旁的RNA测序数据和临床特征数据,针对差异表达基因采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和套索算法(LASSO)构建胃癌预后lncRNA模型,以绘制受试者工作特征曲线(ROC)及Kaplan-Meier曲线评价模型,绘制单基因ROC


 
   
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